Trước đó, ngày 6/8/2021, Cục Thuế TP. HCM đã có Quyết định số 22/QĐ-CT-KN về việc giải quyết khiếu nại của Công ty thế kỷ 21 (lần đầu) do Cục trưởng Lê Duy Minh ký. Theo nội dung khiếu nại, Công ty thế kỷ 21 không đồng ý với số tiền thuê đất phải nộp là hơn 511,9 tỷ đồng tại Thông báo nộp tiền thuê đất số 268/TB-CTTPHCM ngày 8/1/2021 và số tiền sử dụng đất phải nộp là hơn 4.664 tỷ đồng tại Thông báo nộp tiền sử dụng đất số 269/TB-CTTPHCM ngày 8/1/2021 của Cục Thuế TP. HCM.
Do trong thời gian khiếu nại cơ quan thuế, Công ty đồng thời khiếu nại Quyết định số 4777/QĐUBND ngày 29/12/2020 của UBND TP. HCM về việc phê duyệt phương án giá đất đối với khu đất 30,106 ha thuộc dự án khu dân cư và du lịch – văn hóa – giải trí (thuộc khu dân cư Nam Rạch Chiếc), phường An Phú, Quận 2 để Công ty Thế kỷ 21 thực hiện nghĩa vụ tài chính.
Do đó, Công ty Thế kỷ 21 đề nghị Cục Thuế xem xét tạm dừng việc thực hiện nộp tiền thuê đất, tiền sử dụng đất và không tính tiền chậm nộp đối với 2 thông báo nêu trên.
Căn cứ pháp lý để giải quyết khiếu nại, Cục Thuế TP. HCM đưa ra kết luận nội dung khiếu nại của Công ty Thế kỷ 21 là sai toàn bộ, đồng thời đưa ra những nhận định và căn cứ cho kết luận này
Theo Cục Thuế TP. HCM, kết quả xác minh là ngày 12/4/2004, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 1578 về thu hồi và tạm giao đất cho Công ty để tiến hành bồi thường, giải phóng mặt bằng tại phường Bình Khánh, Bình Trưng Tây, quận 2.
Ngày 31/5/2010, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 2405 về giao đất cho Công ty để đầu tư xây dựng khu nhà ở tái định cư tại phường Bình Khánh, quận 2. (Đến ngày 16/12/2020, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 4624UBND về chấm dứt việc giao khu đất hơn 30,2 ha tại phường Bình Khánh, quận 2 cho Công ty tại Quyết định số 2405 ngày 31/5/2010 của UBND TP).
Ngày 24/3/2016, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 1392 về duyệt phương án giá đất theo thị trường đối với khu đất hơn 30,2 ha tại phường Bình Khánh, quận 2 và khu đất 30.106 ha Nam Rạch Chiếc, phường An Phú để giải quyết hoán đổi cho Công ty T.. Trong đó, xác định nghĩa vụ tài chính công ty phải thực hiện sau khi hoán đổi là hơn 52,68 tỷ đồng.
Đến ngày 28/12/2018, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 6002/QĐ-UBND về thu hồi, hủy bỏ Quyết định số 1392/QĐ-UBND; thực hiện Quyết định này, ngày 13/3/2019, Cục Thuế phát hành Văn bản số 2154/CT-KTTĐ về thu hồi, hủy bỏ thông báo nộp tiền sử dụng đất số 3343/TB-CT để thực hiện hoàn trả cho công ty theo quy định.
Ngày 18/4/2017, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 1812/QĐ-UBND về chấp hành cho Công ty thế kỷ 21 sử dụng đất tại phường An Phú, quận 2 để đầu tư dự án khu dân cư và du lịch-văn hóa-giải trí (thuộc khu dân cư Nam Rạch Chiếc);
Ngày 27/12/2017, UBND TP. HCM phát hành Công văn số 8053/UBND-ĐT (khẩn) gửi Cục Thuế về việc xử lý tạm nộp tiền sử dụng đất (trong đó có dự án Lakeview City, phường An Phú, quận 2, tạm nộp 80 tỷ đồng) và thực hiện công văn này ngày 29/12/2017, Cục Thuế phát hành thông báo tạm nộp tiền sử dụng đất số 18938/TB-CT với số tiền sử dụng đất phải nộp là 80 tỷ đồng; cùng ngày, công ty đã thực hiện nộp đủ số tiền nêu trên.
Đến ngày 29/12/2020, UBND TP. HCM ban hành Quyết định số 4777/QĐ-UBND về phê duyệt phương án giá đất đối với khu hơn 30,1 ha thuộc dự án khu dân cư và du lịch-văn hóa-giải trí (thuộc khu dân cư Nam Rạch Chiếc), phường An Phú, quận 2 để Công ty thế kỷ 21 thực hiện nghĩa vụ tài chính. Căn cứ Quyết định số 1812/QĐ-UBND và Quyết định số 4777/QĐ-UBND của UBND TP. HCM, phiếu chuyển thông tin số 113/PC-STNMT-QLĐ ngày 6/1/2021 để xác định nghĩa vụ tài chính về đất đai của Sở Tài nguyên và Môi trường; ngày 8/1/2021 Cục Thuế đã ra thông báo số 268 và 269 với tổng số tiền mà Công ty thế kỷ 21 phải nộp là hơn 5.175,9 tỷ đồng (trong đó hơn 511,9 tỷ đồng là tiền thuê đất và hơn 4.664 tỷ đồng là tiền sử dụng đất).
Theo quyết định nêu rõ, việc thu tiền sử dụng đất được căn cứ tại khoản I Điều 14 Nghị định số 45/2014/NĐ-CP ngày 15/5/2014 của Chính phủ và thu tiền thuê đất, thuê mặt nước được căn cứ tại điểm a, khoản I, Điều 22 Nghị định số 46/2014/NĐ-CP ngày 15/5/2014 của Chính phủ.
Do đó, căn cứ hồ sơ, đối chiếu các văn bản nếu trên cho thấy: Cục thuế TP. HCM phát hành thông báo tiền nộp thuê đất số 268/TB-CTTPHHCM ngày 01/01/2021 với số tiền phải nộp là hơn 511.9 tỷ đồng và Thông báo nộp tiền sử dụng đất số 269/TB-CTTPHCM ngày 08/01/2021 với số tiền phải nộp là 4.664 tỷ đồng để công ty thực hiện nghĩa vụ tài chính về đất đai đối với dự án Khu dân cư và du lịch – văn hóa- giải trí, phường An Phú, Quận 2.
Căn cứ hồ sơ, đối chiếu các văn bản nêu trên, Cục Thuế TP. HCM kết luận: Nội dung khiếu nại là sai toàn bộ và không công nhận nội dung khiếu nại của Công ty Cổ phần Thế Kỷ 21. Yêu cầu công ty thực hiện Thông báo số 268 và 269 của Cục Thuế TP. HCM theo quy định.
