Theo dự thảo Quyết định, Khu kinh tế cửa khẩu quốc tế Bờ Y sau khi điều chỉnh có tổng diện tích là 16.000 ha, bao gồm xã Pờ Y, xã Đăk Kan (thôn 1,3,4), xã Đăk Xú (thôn Thung Nai) và thị trấn Plei Kần (thôn 7) thuộc huyện Ngọc Hồi, tỉnh Kon Tum. Ranh giới địa lý được xác định như sau:
Phía Bắc giáp suối Đăk Xú thuộc xã Đăk Xú;
Phía Nam giáp suối Đăk Hang và suối Đăk Koi thuộc xã Sa Loong;
Phía Đông giáp thị trấn Plei Kần và Quốc lộ 14C;
Phía Tây giáp huyện Phu Vông, tỉnh Attapư nước Cộng hòa Dân chủ Nhân dân Lào và huyện Tà Veng, tỉnh Ratanakiri Vương quốc Campuchia.
Hiện, Khu kinh tế cửa khẩu quốc tế Bờ Y có diện tích 70.438 ha, gồm các xã: Saloong, Bờ Y, Đắk Sú, Đắk Dục, Đắk Nông, Đắk Kan và thị trấn Plei Kần thuộc huyện Ngọc Hồi.
Diện tích được sử dụng cho phát triển đô thị khoảng 18.704 ha, trong đó: Đất dân dụng khoảng 4.948 ha; xây dựng khu dân cư nông thôn khoảng 3.377 ha; phát triển du lịch khoảng 18.836 ha; xây dựng sân bay thương mại quốc tế khoảng 700ha.
Sau điều chỉnh, khu kinh tế cửa khẩu quốc tế Bờ Y được tổ chức thành các khu chức năng gồm khu công nghiệp, khu du lịch, khu đô thị, dân cư và các khu chức năng khác phù hợp với quy định của pháp luật và đặc điểm của địa phương. Quy mô, vị trí từng khu chức năng được xác định trong quy hoạch chung xây dựng và quy hoạch chi tiết Khu kinh tế cửa khẩu quốc tế Bờ Y, tỉnh Kon Tum.
Hoạt động và các cơ chế, chính sách đối với Khu kinh tế cửa khẩu quốc tế Bờ Y tỉnh Kon Tum được thực hiện theo pháp luật về đầu tư, pháp luật về doanh nghiệp, Nghị định số 82/2018/NĐ-CP của Chính phủ quy định về quản lý khu công nghiệp và khu kinh tế và các văn bản pháp luật có liên quan khác.