Tại TP Cần Thơ, các dự án du lịch được thanh tra, gồm: Khu du lịch Cồn Cái Khế, dự án mở rộng Làng du lịch sinh thái Mỹ Khánh và dự án Khu đô thị và vui chơi giải trí Cồn Khương.
Đối với dự án mở rộng Làng du lịch sinh thái Mỹ Khánh, nhà đầu tư đã họp dân công bố quy hoạch chi tiết xây dựng tỷ lệ 1/500. Tháng 6/2018, nhà đầu tư đã thỏa thuận bồi thường được khoảng 150.115 m2 (đạt tỷ lệ 76,78% tổng diện tích dự án, diện tích còn lại chưa thoả thuận bồi thường). Đến thời điểm kiểm tra, dự án chậm tiến độ 2 năm.
Nhà đầu tư mới chuyển đổi được 0,32 hecta sang đất sản xuất kinh doanh, diện tích còn lại là đất cá nhân chưa chuyển đổi mục đích sử dụng nhưng đã xây dựng các hạng mục theo dự án và đã đi vào hoạt động.
Theo Thanh tra Chính phủ, trong năm 2015 và 2016, nhà đầu tư sử dụng không đúng mục đích 19.079 m2 đất (nguyên nhân do chưa chuyển đổi mục đích sử dụng đất nông nghiệp sang đất phi nông nghiệp). Tuy nhiên, nhà đầu tư đã kê khai nộp thuế sử dụng đất phi nông nghiệp năm 2017 và đã nộp thuế sử dụng sản xuất kinh doanh 19.701 m2 (trong đó có 19.079 m2 đất nêu trên).
Còn dự án Khu đô thị và vui chơi giải trí Cồn Khương, ngày 10/11/2017, UBND TP Cần Thơ có Quyết định số 2954/QĐ-UBND về việc phê duyệt điều chỉnh dự án quy hoạch chi tiết tỷ lệ xây dựng 1/2000 cho dự án. Sau khi có quyết định điều chỉnh đồ án quy hoạch, Trung tâm phát triển quỹ đất TP Cần Thơ mới thực hiện hợp đồng bồi thường, hỗ trợ, tái định cư dự án. Thời điểm kiểm tra, dự án đang thực hiện công tác đền bù, hỗ trợ, GPMT và tái định cư, chậm tiến độ so vối kế hoạch. Việc GPMB của dự án gặp khó khăn do nhiều hộ gia đình, cá nhân không phối hợp trong việc đo đạc, kiểm đếm lập hồ sơ bồi thường, hỗ trợ và quận Ninh Kiều không còn nhà ở tái định cư.
Dự án Khu du lịch Cồn Cái Khế, kết luận thanh tra cho biết năm 2009, Cục thuế TP Cần Thơ tiến hành xác định lại tiền thuê đất theo Nghị định 142/2005 của Chính phủ và tính truy thu từ thời điểm ngày 4/11/1994 đến năm 2006 của CTCP du lịch Cần Thơ (nhà đầu tư) với số tiền trên 2,2 tỷ đồng.
Tuy nhiên, theo kết luận của Thanh tra Chính phủ, theo quy định tại khoản 2 Điều 9 Nghị định số 142/2005/NĐ-CP của Chính phủ thì CTCP du lịch Cần Thơ thuộc đối tượng phải xác định lại đơn giá thuê đất và đơn giá thuê này chỉ được áp dụng từ ngày 1/1/2006. Do đó, việc Cục thuế TP Cần Thơ tiến hành truy thu tiền thuê đất của công ty này từ năm 1994 đến năm 2005 là không đúng với quy định trên, tiền truy thu chỉ được tính từ ngày 1/1/2006 (số tiền truy thu sai quy định từ năm 1994 đến hết năm 2005 là gần 2 tỷ đồng, chưa tính tiền phạt chậm nộp).
Ngày 19/1/2016, Cục thuế TP Cần Thơ ra thông báo nộp tiền thuê đất năm 2016, trong đó giá thuê 32.612,6 m2 đất, loại đất thương mại dịch vụ (TMD) là 1.634.725.248 đồng/năm. Việc xác định giá thuê đất như trên là chưa phù hợp theo quy định tại khoản 2, Điều 4 Thông tư số 333/2016 của Bộ Tài chính. Do đó, Thanh tra Chính phủ đề nghị Cục thuế TP Cần Thơ thực hiện điều chỉnh lại đơn giá thuê đất từng thời kỳ của CTCP du lịch Cần Thơ theo đúng quy định của Bộ Tài chính.
Dự án Khu đô thị sinh thái cồn Ấu của CTCP đầu tư Tập đoàn địa ốc Nova. Khu đất xây dựng dự án nằm ở quận Cái Răng có diện tích 45.640m2, doanh nghiệp chuyển mục đích sử dụng đất không tiếp giáp với các tuyến đường giao thông không có trong phụ lục bảng giá đất ở đô thị và bảng giá đất sản xuất kinh doanh tại Quyết định 22/2014 của UBND TP Cần Thơ.
Việc Sở Tài nguyên và Môi trường xác định là đất ở nông thôn và Chi cục thuế quận Cái Răng áp giá đất ở nông thôn cho diện tích 45.640m2 của dự án trong khi tại 4 giấy chứng nhận quyền sử dụng đất (số CG824679 đến số CG824682) được xác định là đất ở đô thị là chưa phù hợp với Thông tư 36/2014 của Bộ Tài nguyên và Môi trường và chưa trình HĐND thành phố Cần Thơ để phê duyệt khung giá đất đối với dự án.
Từ những vi phạm nêu rõ tại từng dự án, Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo UBND TP Cần Thơ thực hiện điều chỉnh lại đơn giá thuê đất từng thời kỳ của CTCP Du lịch Cần Thơ theo đúng quy định; yêu cầu chủ đầu tư mở rộng Làng du lịch Mỹ Khánh thực hiện chuyển đổi diện tích đất đang sử dụng sai mục đích sang đất sản xuất kinh doanh.
Ngoài ra, UBND TP Cần Thơ chỉ đạo Sở TN&MT phối hợp với Cục Thuế thành phố áp dụng đúng loại đất đối với dự án Khu đô thị du lịch sinh thái cồn Ấu. Trường hợp xác định là đất ODT thì phải xác định lại giá đất để tính tiền sử dụng đất nhằm đảm bảo không thất thu ngân sách nhà nước.
