Ngày 13/7, Cơ quan CSĐT Bộ Công an cho biết đã hoàn tất kết luận điều tra, chuyển hồ sơ sang VKSND Tối cao, đề nghị truy tố các bị can: Vũ Huy Hoàng (SN 1953, đã bị xóa tư cách nguyên Bộ trưởng Bộ Công Thương); Phan Chí Dũng (SN 1957, nguyên Vụ trưởng Vụ Công nghiệp nhẹ - Bộ Công Thương); Nguyễn Hữu Tín (nguyên Phó Chủ tịch UBND TP HCM); Đào Anh Kiệt (SN 1957, nguyên Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường TP HCM); Lâm Nguyên Khôi (SN 1955, nguyên Phó Giám đốc Sở Kế hoạch - Đầu tư TP HCM), cùng 4 người khác.
Hai bị can Vũ Huy Hoàng và Phan Chí Dũng bị đề nghị truy tố tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí". Ông Nguyễn Hữu Tín, Đào Anh Kiệt và các bị can còn lại bị truy tố tội "Vi phạm quy định về quản lý đất đai".
Đối với bà Hồ Thị Kim Thoa (cựu Thứ trưởng Bộ Công Thương), do đã bỏ trốn, thời hạn điều tra vụ án đã hết nên Bộ Công an ra quyết định truy nã, quyết định tạm đình chỉ điều tra vụ án, tạm đình chỉ điều tra bị can. Khi nào Bộ Công an bắt được bà Thoa sẽ phục hồi điều tra, xử lý theo quy định của pháp luật.
Bộ Công an nhận định bà Thoa là người có trình độ, kinh nghiệm và hiểu biết trong công tác quản lý nhà nước về kinh tế, công nghiệp, công tác chỉ đạo, điều hành đối với hoạt động các tổng công ty, doanh nghiệp nhà nước (DNNN) thuộc Bộ Công Thương.
Đồng thời, bà Thoa trải qua các cương vị công tác như: Giám đốc Công ty Bóng đèn Điện Quang, Phó Chủ tịch Hiệp hội Thủy tinh Việt Nam, ủy viên Ban Chấp hành Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt Nam (VCCI) và giữ chức Thứ trưởng Bộ Công Thương từ tháng 5-2010.
Bà Thoa phụ trách Vụ Công nghiệp nhẹ và Tổng Công ty Cổ phần Bia - Rượu - Nước giải khát Sài Gòn (Sabeco); chịu trách nhiệm trước bộ trưởng Bộ Công Thương về thực hiện quyền, trách nhiệm, nghĩa vụ của chủ sở hữu nhà nước đối với DNNN và vốn nhà nước đầu tư vào doanh nghiệp khác, trong đó có Sabeco.
Bộ Công an nhận định bà Thoa biết khu đất 2-4-6 Hai Bà Trưng, phường Bến Nghé, quận 1, TP HCM được sắp xếp, giao cho Bộ Công Thương, Sabeco để quản lý, sử dụng, đầu tư, xây dựng khách sạn 6 sao, trung tâm thương mại, trung tâm hội nghị, hội thảo và văn phòng cho thuê, không được thành lập pháp nhân mới.
Tuy nhiên, bà Thoa vẫn báo cáo cho ông Vũ Huy Hoàng phê duyệt, ký 3 văn bản chấp nhận chủ trương cho Sabeco liên doanh, liên kết thành lập Công ty Sabeco Pearl. Đồng thời, lợi dụng việc sắp xếp cơ sở nhà đất của DNNN làm thủ đoạn để dần chuyển dịch quyền sử dụng khu đất 2-4-6 Hai Bà Trưng từ Sabeco sang Công ty Sabeco Pearl, nghĩa là từ tài sản nhà nước sang tư nhân.
Căn cứ ý kiến phê duyệt, chỉ đạo của bà Hồ Thị Kim Thoa, Công ty Sabeco Pearl đã được làm chủ đầu tư dự án, thực hiện nghĩa vụ tài chính và chuyển quyền sử dụng đất từ Sabeco sang Công ty Sabeco Pearl. Từ đó, các sở, ngành tại TP HCM tham mưu cho ông Nguyễn Hữu Tín ký ban hành quyết định cho Công ty Sabeco Pearl thue đất trái pháp luật.
Ngay sau khi Công ty Sabeco Pearl làm chủ đầu tư, chuyển quyền sử dụng đất, mặc dù chưa triển khai hoạt động nhưng vào tháng 2-2016, lợi dụng chủ trương thoái vốn của Chính phủ, thực hiện ý kiến chỉ đạo của ông Vũ Huy Hoàng, bà Hồ Thị Kim Thoa đã ký 2 văn bản chỉ đạo Sabeco thoái 26% vốn tại Công ty Sabeco Pearl và phê duyệt giá khởi điểm là 13.247 đồng/cổ phần.
Đến nay, Công ty CP Đầu tư Quảng trường Mê Linh (tiền thân là Công ty Sabeco Pearl; doanh nghiệp 100% vốn tư nhân) đã đứng tên quyền sử dụng lô đất 2-4-6 Hai Bà Trưng.
Hậu quả, thiệt hại, thất thoát do bà Hồ Thị Kim Thoa cùng đồng phạm gây ra cho ngân sách nhà nước (NSNN) trong công tác quản lý, sử dụng lô đất 2-4-6 Hai Bà Trưng là đặc biệt nghiêm trọng.