Dự thảo quy định rõ về miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Theo đó, điều kiện áp dụng là: Doanh nghiệp khoa học và công nghệ (KHCN) được hưởng ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN nếu đáp ứng điều kiện doanh thu của sản phẩm hình thành từ kết quả KHCN đạt tỷ lệ tối thiểu 30% trên tổng doanh thu của doanh nghiệp.
Mức ưu đãi, miễn giảm thuế TNDN như sau: Doanh nghiệp KHCN được hưởng ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN như doanh nghiệp thực hiện dự án đầu tư mới thuộc lĩnh vực nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, cụ thể như sau: Miễn thuế 4 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp theo đối với thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh các sản phẩm hình thành từ kết quả khoa học và công nghệ.
Thời gian miễn thuế, giảm thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên doanh nghiệp KHCN có thu nhập chịu thuế từ hoạt động sản xuất, kinh doanh các sản phẩm hình thành từ kết quả KHCN được hưởng ưu đãi thuế. Trường hợp không có thu nhập chịu thuế trong ba năm đầu, kể từ năm đầu tiên có doanh thu từ hoạt động sản xuất, kinh doanh các sản phẩm hình thành từ kết quả KHCN thì thời gian miễn, giảm thuế được tính từ năm thứ tư.
Trong thời gian đang được ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN, nếu trong năm tài chính mà doanh nghiệp KHCN không đáp ứng điều kiện về doanh thu của sản phẩm hình thành từ kết quả KHCN đạt tỷ lệ tối thiểu 30% trên tổng doanh thu của doanh nghiệp thì không được hưởng ưu đãi trong năm tài chính đó mà phải nộp thuế TNDN theo mức thuế suất phổ thông và năm đó sẽ tính trừ vào thời gian được hưởng ưu đãi thuế TNDN của doanh nghiệp KHCN.
Trường hợp doanh nghiệp KHCN đã có thu nhập chịu thuế nhưng thời gian hoạt động của năm đầu tiên dưới 12 tháng thì doanh nghiệp được lựa chọn hưởng miễn thuế, giảm thuế ngay trong năm đó hoặc đăng ký với cơ quan thuế thời gian bắt đầu được miễn thuế, giảm thuế vào năm tiếp theo. Nếu doanh nghiệp đăng ký để miễn thuế, giảm thuế vào năm tiếp theo thì phải xác định số thuế phải nộp của năm đã có thu nhập chịu thuế để nộp vào ngân sách nhà nước theo quy định.
Doanh nghiệp KHCN tự xác định số thuế TNDN được ưu đãi và kê khai vào Bảng kê ưu đãi thuế TNDN. Bảng kê ưu đãi thuế TNDN được gửi kèm theo tờ khai quyết toán thuế TNDN hàng năm.
>> Giảm 50% số thuế cho startup khoa học và công nghệ Việt Nam
