Cụ thể, Phó Thủ tướng yêu cầu Bộ GTVT kiểm điểm và chỉ đạo kiểm điểm nghiêm túc trách nhiệm các cá nhân liên quan đến sai phạm xảy ra tại Cục Đường thủy nội địa Việt Nam; phối hợp chặt chẽ với Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an trong quá trình xử lý vụ việc này; báo cáo kết quả lên Thủ tướng Chính phủ.
Trước đó, Bộ GTVT đã có Kết luận số 9633/KL-BGTVT về việc xác minh thông tin nghi vấn “quỹ đen” tại Cục Đường thủy nội địa Việt Nam theo phản ánh của báo chí.
Theo kết luận này, có 9 cá nhân là chuyên viên, trưởng các phòng nghiệp vụ đề xuất chi, sau đó lấy tiền từ ông Phạm Văn Thông để chi phí chung cho Cục Đường thủy nội địa 406 triệu đồng.
Trong đó, các cá nhân trực tiếp nhận từ ông Phạm Văn Thông là 357 triệu đồng. Ông Thông chi cho các hoạt động của Cục Đường thủy nội địa (như hội nghị, hội thảo, phòng nghỉ, ăn uống, tiếp khách) 49,3 triệu đồng.
Kết luận của Tổ xác minh cho hay trên giấy tờ, tổng cộng ông Phạm Văn Thông đã nhận tiền của 15 nhà thầu với tổng tiền là 4,8 tỷ đồng. Tuy nhiên, hồ sơ xác minh lại có tới 10 nhà thầu không ký tên, có 5 nhà thầu đưa tiền và ký tên.
Cụ thể, 5 nhà thầu có ký tên nộp tiền gồm: Công ty tư vấn GTCC Hải Phòng (628.106.364 đồng), Công ty Đất Việt ( 258.833.182 đồng), Công ty Cổ phần tư vấn xây dựng công trình thủy (321.000.000 đồng), Công ty HCC và Công ty ALPHA (ký nộp cho ông Nguyễn Long – Trưởng phòng Tài chính 100.000.000 đồng - tạm ứng), Công ty tư vấn 89 (ký nộp 330.000.000 đồng). Tuy nhiên, ông Long không thừa nhận việc nhận tiền từ Công ty HCC và Công ty ALPHA.
Sau đó, Bộ GTVT cũng đã có Quyết định số 1913/QĐ - BGTVT thu hồi số tiền 406.318.526 đồng của Cục Đường thủy nội địa Việt Nam. Đầu tháng 9 Cục Đường thủy nội địa Việt Nam đã thực hiện nộp 406.318.526 đồng vào Kho bạc Nhà nước Hà Nội thông qua tài khoản tạm giữ của Thanh tra Bộ GTVT.
Bộ GTVT đã ban hành Quyết định số 1912/QĐ - BGTVT thu hồi số tiền 4.394.332.074 đồng của ông Phạm Văn Thông, nguyên Giám đốc Ban Quản lý dự án đường thủy nội địa, do ông Thông khai nhận thu tiền của các nhà thầu không đúng quy định.
Đầu tháng 9 ông Phạm Văn Thông, nguyên Giám đốc Ban Quản lý dự án đường thủy nội địa đã thực hiện nộp số tiền 4.394.332.074 đồng vào Kho bạc Nhà nước Hà Nội thông qua tài khoản tạm giữ của Thanh tra Bộ GTVT.
