Theo nghị quyết số 32 của HĐQT Tập đoàn Hoa Sen ban hành ngày 15/6/2019, lý do chấm dứt hoạt động là vì doanh nghiệp đang sở hữu, vận hành hơn 10 nhà máy sản xuất từ Bắc vào Nam. Do đó, nhằm tối ưu hóa và linh hoạt trong hoạt động vận tải, HĐQT quyết định sắp xếp lại mảng vận tải, điều chuyển các phương tiện vận tải từ công ty sang các nhà máy để tăng tính chủ động trong việc điều phối vận tải, chuyên chở hàng hóa, vật liệu...
"Tại thời điểm thông qua chủ trương, theo thông báo của Tập đoàn Hoa Sen, công ty TNHH MTV Vận tải và Cơ khí Hoa Sen đã quyết toán, thanh lý các giao dịch; tất toán các khoản nợ và nghĩa vụ tài chính. Ngoài ra, nhân sự thuộc công ty vừa giải thể được Tập đoàn Hoa Sen khẳng định là đã "bố trí, điều động, sắp xếp ổn định".
Việc giải thể công ty TNHH MTV Vận tải và Cơ khí Hoa Sen là động thái mới nhất liên quan tới kế hoạch tái cấu trúc hệ thống phân phối theo mô hình chi nhánh tỉnh, phục vụ công tác chuyển đổi các chi nhánh thành địa điểm kinh doanh thuộc chi nhánh tỉnh nhằm tăng cường hiệu quả hoạt động của tập đoàn này.